Marco de Vivo este chimist computațional la Institutul Italian de Tehnologie unde ocupă funcția de Director Asociat în Științe Computaționale, fiind totodată coordonator al Laboratorului de Modelare Moleculară și Cercetare Medicamentoasă. În cadrul muncii de laborator, combină principii din domenii precum chimie computațională, chimie medicală, biologie structurală, date biochimice, date farmaceutice pentru a înțelege funcționarea enzimelor și pentru a crea molecule noi.
Ovidiu Mățan: Bună, Marco! Bine ați venit la Cluj, la evenimentul organizat de Societatea de Biologie Cuantică și Farmacologie!
Marco de Vivo: Bună ziua! Vă mulțumesc pentru invitație!
Vă rog să ne spuneți mai multe despre această organizație pe care, înțeleg că o veți conduce în curând.
Marco de Vivo: Este o onoare pentru mine să fiu următorul președinte al Societății Internaționale de Biologie Cuantică și Farmacologie, un grup renumit de cercetători de peste tot din lume. Organizăm un eveniment internațional din doi în doi ani, iar anul acesta avem drept invitați doi distinși oameni de știință, câștigători ai mai multor premii de Biologie Computațională. Particip zilele acestea la acest eveniment internațional care se dovedește a fi unul de anvergură.
Ne bucurăm să vă avem alături de noi. Conduceți și Institutul Italian de Tehnologie. Cum integrează tinerii cercetători IA-ul și tehnologia în munca lor?
Marco de Vivo: Traversăm o revoluție. Vedem că IA este peste tot, iar chimia nu face excepție. Există multe arii în care vedem că IA aduce o contribuție esențială, fiind un ingredient principal. Ne bucurăm să vedem cum generația nouă manifestă interes pentru IA, fapt care, de altfel, nu poate fi evitat. Trebuie să integrăm IA în munca noastră, mai ales în chimia computațională. Folosim calculatorul pentru a studia reacțiile chimice, dar și interacțiunea dintre atomi. Colectăm foarte multe date care, interpretate cu IA, pot duce la idei interesante.
Înțeleg. Ce modele sau super computer folosiți pentru a modela molecule și componente biologice?
Marco de Vivo: În cadrul comunității noastre, lucrăm preponderent cu simulări moleculare. Folosim GPU și cod ce rulează pe GPU-uri. Folosim IA și Machine Learning pentru a studia interacțiunea dintre molecule și consecințele acestei interacțiuni în biochimie și farmacologie. Analizăm molecule precum proteinele și acizii nucleici, precum și modul în care acestea interacționează în timp. Putem folosi mai multe tipuri de cod pentru a studia această interacțiune. E fascinant.
Sună foarte bine. În aceste zile, are loc și un festival la Cluj. Ați reușit să vedeți vreun film? Un SF, poate?
Marco de Vivo: Nu, doar ne-am plimbat. Sunt pentru prima oară aici la Cluj. Mă bucur de oraș și sunt recunoscător actualului președinte pentru invitație. Poate vom vedea niște filme în această seară. Vă mulțumesc.
de Vlad Petrean